在重庆市歌乐山麓，距白公馆2.5公里。渣滓洞红色基地原为商人程尔昌名下的煤窑，开办于1920年，三面环山，一面临沟，但出煤一直很少，渣又多，程尔昌因此背负了不少债务。1931年8月，程尔昌到自贡找好友借钱应对经济萧条，却因喉癌晚期，一个月以后死于自贡。煤窑就交给了当时的托管委员会处理，并承包给一名矿主。1943年，中美特种技术合作所成立后，白公馆被改为中美合作所第三招待所，所以必须寻觅新址关押白公馆所关的“犯人”。国民党军统总务处长沈醉亲自开着车到处察看，最终因地形隐蔽看上了渣滓洞。于是，国民党军统局强征渣滓洞改为监狱，象征性出了一点钱，用“白菜钱”买下了这座煤窑。当时的矿主活生生被气死。

看守所分为内外两院，外院刑讯室和特务办公室所组成；内院一楼一底16间房间为男牢，另有2间平房为女牢，在此关押的人，主要是因为《挺进报》事件、六.一学潮、川东武装起义以及小民革案被捕的政治犯，多达300多人，其中《红岩》小说中的江姐的人物原型江竹筠也关押其中。1946年7月，息烽监狱、望龙门看守所撤销，息烽、望龙门、渣滓洞监狱兼看守所合为渣滓洞监狱兼看守所，并将原息烽、望龙门监狱兼看守所的全体在押人员撤并渣滓洞监狱兼看守所。中美合作所撤销后，犯人于1947年4月回迁，渣滓洞监狱被合并至白公馆看守所，但暂时废弃。

1947年12月，渣滓洞红色基地重新关押犯人，称“重庆行辕二处第二看守所”。关押的人员主要是1947年“六一大逮捕”中被捕的教育、新闻界人士，“小民革”地下武装案被捕人员，上下川东三次武装起义被俘、被捕人员，《挺进报》事件被捕人员，民革川东、川康分会成员等，最多时关押过三百多人。江竹筠、许建业、余祖胜等曾在此关押过。1949年11月底重庆解放前夕，囚禁于此的二百多位革命志士被杀害。